Pankreatisk ribonukleas | |
---|---|
Struktur av RNase A | |
Identifierare | |
Kod KF | 3.1.27.5 |
CAS-nummer | 9001-99-4 |
Enzymdatabaser | |
IntEnz | IntEnz-vy |
BRENDA | BRENDA inträde |
ExPASy | NiceZyme-vy |
MetaCyc | Metabolisk väg |
KEGG | KEGG inträde |
PRIAM | profil |
PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
Genontologi | AmiGO • EGO |
Sök | |
PMC | artiklar |
PubMed | artiklar |
NCBI | NCBI-proteiner |
CAS | 9001-99-4 |
Pankreatisk ribonukleas | |
---|---|
Identifierare | |
Symbol | RNaseA |
Pfam | PF00074 |
SMART | SM00092 |
PROSITE | PDOC00118 |
Tillgängliga proteinstrukturer | |
Pfam | strukturer |
PDB | RCSB PDB ; PDBe ; PDBj |
PDBsumma | 3D-modell |
Pankreatiska ribonukleaser ( EC-kod 3.1.27.5 , RNas, RNas I, RNas A, pankreatisk RNas, ribonukleas I, endoribonukleas I, ribonukleinfosfatas, alkaliskt ribonukleas, ribonukleas, ribonukleas, S-gen C, glycoprotein S-genglycoprotein, S-gen C, S-gen glykobonukleas-associerad glykoproteiner, ribonukleat 3'-pyrimidino-oligonukleotidhydrolas ) är pyrimidinspecifika endonukleaser som finns i stort antal i bukspottkörteln hos vissa däggdjur och vissa reptiler [1] .
Speciellt är enzymerna involverade i den endonukleolytiska klyvningen av 3'-fosfomononukleotider och 3'-fosfoligonukleotider som slutar i CP eller UP med 2',3'-cykliska fosfatintermediärer. Ribonukleas kan varva ner RNA-helixen och bilda ett komplex med enkelsträngat RNA; komplexet uppstår som ett resultat av en förlängd multisite katjon-anjon-interaktion mellan lysin- och argininresterna av enzymet och fosfatgrupperna i nukleotiderna.
Bovint pankreatisk ribonukleas är den mest studerade medlemmen av familjen och fungerar som ett modellsystem i arbete relaterat till proteinveckning , disulfidbindningsbildning , proteinkristallografi och spektroskopi och proteindynamik [2] . Det mänskliga genomet innehåller 8 gener som delar struktur och funktion med bovint pankreatisk ribonukleas, med 5 ytterligare pseudogener. Strukturen och dynamiken hos dessa enzymer är relaterade till mångfalden av deras biologiska funktioner [3] .
Andra proteiner som hör till bukspottkörtelns ribonukleas-superfamilj inkluderar: ribonukleaser från bovina och hjärnans seminalvesikel; icke-sekretoriska ribonukleaser i njurarna [4] ; ribonukleas av levertyp [5] ; angiogenin , som orsakar vaskularisering av normala och maligna vävnader; eosinofilt katjoniskt protein [6] , cytotoxin och helmintotoxin med ribonukleasaktivitet; och grodlever-ribonukleas och sialinsyrabindande lektin. Sekvensen av pankreatiska ribonukleaser innehåller fyra konserverade disulfidbindningar och tre aminosyrarester involverade i katalytisk aktivitet [7] .
Humana gener som kodar för proteiner som innehåller denna domän inkluderar:
Vissa medlemmar av familjen pankreatisk ribonukleas har cytotoxiska effekter. Däggdjursceller är skyddade från dessa effekter på grund av deras extremt höga affinitet för ribonukleasinhibitorn (RI), som skyddar cellulärt RNA från förstörelse av bukspottkörtelribonukleaser [8] . Pankreatiska RNaser som inte hämmas av RI är ungefär lika toxiska som alfa-sarcin , difteritoxin eller ricin [9] .
Två pankreatiska ribonukleaser isolerade från nordliga leopardgrodaoocyter , amfinas och ranpyrnas , hämmas inte av RI och uppvisar differentiell cytotoxicitet mot tumörceller [10] . Ranpirnase har studerats i fas 3 kliniska prövningar som en kandidat för behandling av mesoteliom , men prövningen visade inte statistisk signifikans för de viktigaste effektmåtten [11] .
Enzymer | |
---|---|
Aktivitet | |
förordning | |
Klassificering | |
Typer |
|
Hydrolaser ( EC 3): esteraser ( EC 3.1) | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
EC 3.1.1: Hydrolaser av karboxylsyraestrar | |||||||||||||||
EC 3.1.2: Tioesteraser |
| ||||||||||||||
EC 3.1.3: Fosfataser |
| ||||||||||||||
EC 3.1.4: Fosfodiesteraser |
| ||||||||||||||
EC 3.1.6: Sulfatas |
| ||||||||||||||
Nukleaser (inklusive deoxiribonukleaser och ribonukleaser ) |
|