Icke-kodande RNA

Icke-kodande RNA (icke-kodande RNA, ncRNA) - RNA- molekyler som inte översätts till proteiner . Den tidigare använda synonymen  - "litet RNA" (smRNA, litet RNA) - har gått ur bruk, eftersom vissa icke-kodande RNA kan vara mycket stora, till exempel Xist .

Den DNA-sekvens på vilken icke-kodande RNA transkriberas kallas ofta för RNA -genen .

Icke-kodande RNA inkluderar [1] :

• överföra RNA (tRNA),
• ribosomalt RNA (rRNA),
• litet nukleärt RNA (snRNA, snRNA),
• litet nukleolärt RNA (snoRNA, snoRNA),
• antisens-RNA (aRNA),
• mikroRNA (miRNA),
• litet störande RNA (siRNA),
• piRNA (piwiRNA, piRNA),
• långt icke-kodande RNA  (lncRNA) - Xist , Evf , Air , CTN , PINK , TUG1 .

Nya transkriptomiska teknologier ( RNA-sekvensering ) och DNA-mikroarraytekniker har identifierat mer än 30 000 långa icke-kodande RNA:n ( långt ncRNA  ) . Det antas att de "hanterar" den selektiva landningen av polycomb-repressorkomplex på vissa kromatinregioner , såväl som direkta DNA-metyltransferaser och, möjligen, reglerar selektiv DNA-metylering [2] [3] [4] [5] . Dessutom, som det visade sig, utgör de en betydande del (~20% av det totala antalet långa icke-kodande RNA i däggdjursgenom ), de så kallade divergerande dsnRNA :erna, som transkriberas i motsatt riktning till närliggande proteinkodande gener , reglerar transkriptionen av dessa angränsande gener [6] .

Anteckningar

1. ↑ Lee T.I. , Young RA Transcriptional Regulation and its misregulation in disease.  (engelska)  // Cell. - 2013. - Vol. 152, nr. 6 . - P. 1237-1251. - doi : 10.1016/j.cell.2013.02.014 . — PMID 23498934 .
2. ↑ Merry, CR, Forrest, ME, Sabres, JN, Beard, L., Gao, XH, Hatzoglou, M., ... & Khalil, AM DNMT1-associerade långa icke-kodande RNA reglerar globalt genuttryck och DNA-metylering i tjocktarmscancer // Human molekylär genetik. - 2015. - T. 24 , nr 21 . - S. 6240-6253 . doi : 10.1093 / hmg/ddv343 .
3. ↑ Hantera metylering . Hämtad 19 juli 2022. Arkiverad från originalet 28 november 2016. (obestämd)
4. ↑ Daniel Holoch & Danesh Moazed. RNA-medierad epigenetisk reglering av genuttryck // Naturrecensioner. genetik. - 2015. - T. 16 , nr 2 . — s. 71–84 . - doi : 10.1038/nrg3863 . — PMID 25554358 .
5. ↑ Jeffrey J. Quinn & Howard Y. Chang. Unika egenskaper hos lång icke-kodande RNA-biogenes och funktion // Naturrecensioner. genetik. - 2015. - T. 17 , nr 1 . — s. 47–62 . - doi : 10.1038/nrg.2015.10 . — PMID 26666209 .
6. ↑ Sai Luo, J. Yuyang Lu, Lichao Liu, et al., & Xiaohua Shen. Divergenta lncRNA reglerar genuttryck och härstamningsdifferentiering i pluripotenta celler // Cellstamceller. - 2016. - doi : 10.1016/j.stem.2016.01.024 .

Länkar

• Ishitani R, Yokoyama S, Nureki O. Struktur, dynamik och funktion hos RNA-modifieringsenzymer // Curr Opin Struct Biol. - 2008. - T. 18 , nr 3 . - S. 330-339 .
• Yeung ML, Benkirane M, Jang KT. Små icke-kodande RNA, däggdjursceller och virus: regulatoriska interaktioner?  // Retrovirologi. - 2007. - T. 4 . - S. 74 .

Se även

• RNA-sekvensering
• Ultrakonservativa element av DNA
• Långa och korta icke-kodande RNA (lncRNA och miRNA) som interagerar med polycomb repressorkomplex.