ShRNA

Små hårnåls-RNA eller shRNA ( kort hårnåls-RNA, liten hårnåls-RNA, kort hårnåls-RNA ) är korta ribonukleinsyramolekyler som bildar täta hårnålar (stam-loop-strukturer) i den sekundära strukturen .  ShRNA kan användas för att undertrycka genuttryck genom RNA-interferens . Korta hårnåls-RNA:n introduceras i celler med användning av vektorer där deras kodande sekvenser är under kontroll av konstitutivt aktiva (såsom U6) eller inducerbara promotorer . Sådana vektorer innehåller vanligtvis nukleotidsekvenser som gör att de kan integreras i cellgenomet och därigenom tillhandahålla ärftlig suppression av uttrycket av målgenen [1] .

Små hårnålsbildande RNA:n transkriberas av RNA-polymeras III . Bildandet av shRNA i däggdjursceller utlöser ibland ett interferonsvar för att skydda cellen, som i fallet med en viral attack. Sådana processer observeras inte i fallet med miRNA ( miRNA ), som transkriberas av RNA-polymeras II [2] .

Efter att transkriptionen är klar skärs små hårnåls-RNA av cellulära enzymer för att bilda små interfererande RNA ( siRNA ) .  Små störande RNA är en del av det RNA-inducerade genavstängningskomplexet (RISC). Detta komplex binder till mRNA som är komplementära till siRNA och skär dem.

Små hårnåls-RNA används också i växter. I det här fallet används traditionellt den konstitutivt aktiva CaMV35S-promotorn från blomkålsmosaikvirus-promotorn 35S  [ 3 ] .

Anteckningar

1. ↑ Paddison P., Caudy A., Bernstein E., Hannon G., Conklin D. Kort hårnåls-RNA (shRNA) inducerar sekvensspecifik tystnad i däggdjursceller  // Genes Dev  .  : journal. - 2002. - Vol. 16 , nr. 8 . - P. 948-958 . - doi : 10.1101/gad.981002 . — PMID 11959843 .
2. ↑ Cao W., Hunter R., Strnatka D., McQueen C., Erickson R. DNA-konstruktioner utformade för att producera korta hårnålar, interfererande RNA i transgena möss visar ibland tidig dödlighet och ett interferonsvar  //  J. Appl . Genet. : journal. - 2005. - Vol. 46 , nr. 2 . - S. 217-225 . — PMID 15876690 .
3. ↑ McIntyre G., Fanning G. Design och kloningsstrategier för att konstruera shRNA-expressionsvektorer  //  BMC Biotechnol. : journal. - 2006. - Vol. 6 . — S. 1 . - doi : 10.1186/1472-6750-6-1 . — PMID 16396676 .  (inte tillgänglig länk)