Arenavirus

Arenavirus
Lassa virus virioner
vetenskaplig klassificering
Grupp:Virus [1]Rike:RiboviriaRike:OrthornaviraeSorts:NegarnaviricotaUndertyp:PolyploviricotinaKlass:EllioviricetesOrdning:BunyaviralesFamilj:Arenavirus
Internationellt vetenskapligt namn
Arenaviridae
förlossning
Mammarenavirus Reptarenavirus
Baltimore-gruppen
V: (-)ssRNA-virus
Systematik på Wikispecies Bilder på Wikimedia Commons NCBI   11617 EOL   5047

Arenavirus [2] ( lat.  Arenaviridae , från andra grekiska arenosa - sandiga) är en familj av RNA- virus . Namnet på familjen gavs i enlighet med virionens struktur -  som så att säga är beströdd med sand. Virus i tropikerna , dödlighet efter infektion - över 20%.

Konventionellt klassificeras arenavirus i New World och Old World virus . Bland de fyra virusen i den gamla världen urskiljs lymfocytiskt koriomeningitvirus , som finns i gnagare runt om i världen, liksom Lassa-febervirus  - upp till 15 000 fall i Västafrika , dödlighet upp till 30%. New World-virus finns hos råttor i Sydamerika .

Virion

Virion är täckt med ett membran som innehåller lipider , har stora spikar på ytan. Innehåller två nukleokapsider . Virions morfologi är multipel, diametern är cirka 62-200 nm, i genomsnitt cirka 110 nm.

Genom

Genomiskt enkelsträngat (-)RNA innehåller två öppna läsramar:

• (S) - 3336-3535 nukleotider, kodar för två polypeptider, två läsramar - NP - nukleokapsid; GPC - skuren i GP1, GP2 - två glykoproteiner
• (L) - 7200 nukleotider, kodar för två proteiner - RNA-polymeras och ett Z-protein som innehåller ett Zn-bindande finger

Replikering

Genomiskt (-)RNA replikerar till (+)antigenomiskt mRNA, som översätts.

Diagnostik

• ELISA mot IgG, inklusive IgM, och i den akuta fasen.
• PCR - under infektion, den mest pålitliga metoden.

Klassificering

År 2014 inkluderades ett nytt släkte Reptarenavirus i familjen arenavirus [3] , och släktet Arenavirus som finns där döptes om till Mammarenavirus tillsammans med alla dess arter [4] . Enligt International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) inkluderar familjen från och med mars 2017 2 släkten [5] :

• Mammarenavirus (33 arter)
  • Chapare mammarenavirus - Chapare virus [6]
  • Flexalt mammarenavirus _ _
  • Guanarito mammarenavirus - Guanarito virus [2] [6]
  • Junín mammarenavirus - Junin virus [2] [6]
  • Lassa mammarenavirus - Lassa virus [2]
  • Lymfocytisk choriomeningit mammarenavirus — Lymfocytisk choriomeningit virus [2] [6]
  • Machupo mammarenavirus - Machupo virus [2] [6]
  • Sabiá mammarenavirus - Sabia-virus [2]
  • Lujo mammarenavirus - Lujo virus [6]
• Reptarenavirus (3 arter)

Anteckningar

1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
2. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Atlas of Medical Microbiology, Virology and Immunology: Lärobok för medicinska studenter / Ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M .  : Medicinsk informationsbyrå, 2003. - S. 131-132. — ISBN 5-89481-136-8 .
3. ↑ Skapa ett nytt släkte, Reptarenavirus , som omfattar tre nya arter i familjen Arenaviridae  : [ eng. ] // ICTVonline. — Tilldelad kod: 2014.011a-dV. - 2014. - 12 sid.
4. ↑ Byt namn på ett (1) släkte och tjugofem (25) arter i familjen Arenaviridae  : [ eng. ] // ICTVonline. — Tilldelad kod: 2014.012aV. - 2014. - 6 sid.
5. ↑ Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Tillgänglig: 26 mars 2017) .
6. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Förteckning över mikroorganismer, toxiner, utrustning och teknik som omfattas av exportkontroll  : [godkänd. Dekret från Ryska federationens president av den 20 augusti 2007 nr 1083]: tjänsteman. text: tillgänglig 1 juni 2016