TRNA

Transfer-RNA, tRNA [1]  är en ribonukleinsyra som säkerställer interaktionen mellan aminosyran , ribosomen och budbärar-RNA (mRNA) under translation . Den har en typisk längd på 73 till 93 nukleotider och en storlek på cirka 5 nm. tRNA, som är kovalent kopplat till aminosyraresten, är direkt involverat i tillväxten av polypeptidkedjan , binder specifikt till mRNA -kodonet och tillhandahåller konformationen av komplexet som är nödvändigt för bildandet av en ny peptidbindning .

Varje proteinogen aminosyra i en cell har sitt eget tRNA (ett eller flera).

Struktur för tRNA

Den sekundära strukturen av tRNA visualiseras vanligtvis som ett klöverblad med fyra armar. Längre tRNA har ytterligare en kort femte arm som kallas den variabla hårnålen. I tredimensionellt utrymme viks tRNA-molekylen till en L-formad struktur på grund av den koaxiala insättningen av spiraler, vilket gör att tRNA kan passa in i P-stället och A-stället i ribosomer [2] . Armarnas längd och diametern på slingorna i tRNA-molekylens sekundära veck varierar från art till art [2] [3] . Huvudkomponenterna i tRNA-molekylen är följande strukturer och funktionella grupper:

• 5'-änd fosfatgrupp. De flesta tRNA bär en guanylat (fG) rest vid 5'-änden.
• Acceptorarm med acceptorskaft och CCA-svans. Acceptorstammen bildas av två komplementärt sammankopplade terminala delar av tRNA-molekylen, den består av 7-9 baspar. Acceptorstammen kan innehålla andra baspar än kanoniska Watson-Crick-baspar, såsom ett AG-par. 3'-änden av acceptorarmen är något längre, den bildar en enkelsträngad region, som slutar med en CCA-sekvens med en fri OH-grupp . Aminoacyl-tRNA-syntetas fäster den transporterade aminosyran till detta ändamål . Aminosyran som laddas på tRNA:t av aminoacyl-tRNA-syntetas är kovalent kopplad till 3'-hydroxylgruppen i det sista adenosinet. Den terminala CCA-sekvensen är viktig för tRNA-igenkänning av enzymer och translation [2] [4] [5] [6] [7] [8] . I vissa prokaryoter finns CCA-sekvensen i gensekvensen, men i de allra flesta fall läggs den terminala CCA-sekvensen till under tRNA-bearbetning och är därför frånvarande från tRNA-genen [9] .
• D-armen har en skaft som är 4 till 6 baspar lång, som slutar i en slinga som ofta innehåller dihydrouridin [2]
• Antikodonarmen har en stam som är 5 bp lång, i slutet av vilken finns en slinga med ett antikodon [2] .
• TΨC-armen har en stam som är 4-5 bp lång, och en slinga i slutet av armen innehåller vanligtvis ribotymidin T och   pseudouridin Ψ [2] .

D- och TΨC-armarna tillhandahåller viktiga interaktioner vid veckningen av tRNA-molekyler; TΨC-armen är involverad i interaktionen med rRNA:t från den stora ribosomsubenheten.

tRNA-bearbetning

tRNA syntetiseras av konventionellt RNA-polymeras i fallet med prokaryoter och av RNA-polymeras III i fallet med eukaryoter . Transkript av tRNA- gener genomgår flerstegsbearbetning , vilket så småningom leder till bildandet av en rumslig struktur som är typisk för tRNA . tRNA-bearbetning inkluderar 5 nyckelsteg [10] :

• avlägsnande av 5'-ledarnukleotidsekvensen;
• avlägsnande av den 3'-terminala sekvensen;
• lägga till en CCA-sekvens vid 3'-änden;
• excision av introner (i eukaryoter och archaea );
• modifieringar av enskilda nukleotider.

Efter avslutad mognad måste eukaryota tRNA överföras till cytoplasman , där de deltar i proteinbiosyntesen. Transport av tRNA utförs längs en Ran -beroende väg med deltagande av transportfaktorn exportin t ( Los1 i jäst ), som känner igen den karakteristiska sekundära och tertiära strukturen hos moget tRNA: korta dubbelsträngade sektioner och korrekt bearbetad 5'- och 3'-ändar. Denna mekanism säkerställer att endast mogna tRNA exporteras från kärnan. Förmodligen kan exportin 5 vara ett hjälpprotein som kan transportera tRNA genom nukleära porer tillsammans med exportin t [11] .

Se även

• Proteinbiosyntes

Anteckningar

1. ↑ Ribosomen kan vara en bro mellan precellulärt och cellulärt liv . Hämtad 1 mars 2015. Arkiverad från originalet 1 mars 2015. (obestämd)
2. ↑ 1 2 3 4 5 6 Itoh Y, Sekine S, Suetsugu S, Yokoyama S (juli 2013). "Tertiär struktur av bakteriellt selenocystein tRNA" . Nukleinsyraforskning . 41 (13): 6729-6738. doi : 10.1093/nar/ gkt321 . PMC 3711452 . PMID 23649835 .  
3. ↑ Goodenbour JM, Pan T (29 oktober 2006). "Mångfald av tRNA-gener i eukaryoter" . Nukleinsyraforskning . 34 (21): 6137-6146. doi : 10.1093/nar/ gkl725 . PMC 1693877 . PMID 17088292 .  
4. ↑ Jahn M, Rogers MJ, Söll D (juli 1991). "Antikodon- och acceptorstamnukleotider i tRNA(Gln) är viktiga igenkänningselement för E. coli glutaminyl-tRNA-syntetas." naturen . 352 (6332): 258-260. Bibcode : 1991Natur.352..258J . DOI : 10.1038/352258a0 . PMID  1857423 .
5. ↑ O.-Ya. L. Beish. Medicinsk biologi. - Vitebsk: Urajay, 2000. - S. 22.
6. ↑ Ibba M, Soll D (juni 2000). "Aminoacyl-tRNA-syntes". Årlig översyn av biokemi . 69 (1): 617-650. DOI : 10.1146/annurev.biochem.69.1.617 . PMID  10966471 .
7. ↑ Sprinzl M, Cramer F (1979). "CCA-änden av tRNA och dess roll i proteinbiosyntes". Framsteg inom nukleinsyraforskning och molekylärbiologi . 22 :1-69. DOI : 10.1016/s0079-6603(08)60798-9 . ISBN  978-0-12-540022-0 . PMID  392600 .
8. ↑ Green R, Noller HF (1997). Ribosomer och översättning . Årlig översyn av biokemi . 66 : 679-716. DOI : 10.1146/annurev.biochem.66.1.679 . PMID  9242921 .
9. ↑ Aebi M, Kirchner G, Chen JY, Vijayraghavan U, Jacobson A, Martin NC, Abelson J, et al. (september 1990). "Isolering av en temperaturkänslig mutant med ett förändrat tRNA-nukleotidyltransferas och kloning av genen som kodar för tRNA-nukleotidyltransferas i jästen Saccharomyces cerevisiae." Journal of Biological Chemistry . 265 (27): 16216-16220. DOI : 10.1016/S0021-9258(17)46210-7 . PMID2204621  . _
10. ↑ Hopper AK, Phizicky EM tRNA överförs till rampljuset  // Genes Dev.. - 2003. - Vol. 17 , nr. 2 . - S. 162-180 . - doi : 10.1101/gad.1049103 . — PMID 12533506 . Arkiverad från originalet den 19 september 2017.
11. ↑ Köhler A., ​​​​Hurt E. Exporterar RNA från kärnan till cytoplasman // Nat. Varv. Mol. Cell Biol .. - 2007. - T. 8 , nr. 10 . - S. 761-773 . - doi : 10.1038/nrm2255 . — PMID 17786152 .

Länkar

• Databas av tRNA från olika organismers genom  (engelska)

Ordböcker och uppslagsverk	Stor dansk Stor ryss Britannica (online) Brockhaus
I bibliografiska kataloger	NKC : ph116389