Coronavirus

Coronavirus

3D-modell av SARS-CoV-2
vetenskaplig klassificering
Grupp:Virus [1]Rike:RiboviriaRike:OrthornaviraeSorts:PisuviricotaKlass:PisoniviricetesOrdning:NidoviralesUnderordning:CornidovirineaeFamilj:Coronavirus
Internationellt vetenskapligt namn
Coronaviridae
Underfamiljer
Baltimore-gruppen
IV: (+)ssRNA-virus

Coronaviruses [2] ( lat.  Coronaviridae ) är en familj av RNA- innehållande virus , inklusive 45 arter i maj 2020, kombinerade till två underfamiljer [3] [4] . De påverkar däggdjur (inklusive människor), fåglar och groddjur. Namnet är förknippat med virusets struktur, vars spikliknande processer liknar solkoronan [2] . Det finns 7 kända coronavirus som infekterar människor [5] [6] [7] :

Etymologi

Namnet "coronavirus" kommer från latinets corona , som betyder "krans", som i sin tur är lånat från andra grekiska. κορώνη korṓnē, "girland, krans" [8] [9] . Namnet myntades av Juna Almeida och David Tyrrell, som var de första att upptäcka och studera mänskliga coronavirus [10] . Ordet användes först i tryck 1968 av en informell grupp virologer i tidskriften Nature för att referera till en ny familj av virus [11] . Namnet hänvisar till det karakteristiska utseendet av virioner (virusets infektiösa form) på elektronmikroskopi, som är kantade med stora upphöjda utsprång på sin yta, vilket skapar en bild som liknar en solkorona eller halo [11] [10] . Denna morfologi skapas av virala spike peplomers, som är proteiner på ytan av viruset [12] .

Det vetenskapliga namnet Coronavirus antogs som släktnamnet av International Committee on Virus Nomenclature (senare omdöpt till International Committee on Virus Taxonomy ) 1971 [13] . När antalet nya arter ökade delades släktet upp i fyra släkten, nämligen Alphacoronavirus , Betacoronavirus , Deltacoronavirus och Gammacoronavirus 2009 [14] . Det vanliga namnet coronavirus används för att referera till vilken medlem som helst av underfamiljen Orthocoronavirinae [15] . Från och med 2020 är 45 arter officiellt erkända [16] .

Epidemiologi

Coronavirus orsakar sjukdomar hos däggdjur ( människor , fladdermöss , katter , hundar , grisar , nötkreatur ) och fåglar . Några  ( ___fåglarhosAvCoVs(Fågelkoronavirus  :exempel TGEV  — porcin transmissible gastroenterit coronavirus och dess patotyp PRCV  — porcin respiratory coronavirus), hos hundar med hundkoronavirus ( CCoV-1 och CCoV-2 /PanCCoV ), hos katter med kattkoronavirus ( FECV  — enteritis coronavirus cats, FIPV  — feline infectious peritonitis coronavirus), hos möss , murint coronavirus ( MCoV , orsakar viral hepatit hos möss, hos råttor RtCoV  — råttcoronavirus, PCoV  — petrel puffinosis coronavirus), etc., finns det många coronavirus i olika arter av fladdermöss [3 ] [17] .

Källor till coronavirusinfektioner kan vara en sjuk person, djur. Möjliga överföringsmekanismer: luftburen, luftburen, fekal-oral, kontakt. Förekomsten ökar på vintern och tidigt på våren. I strukturen för ARVI hos inlagda patienter är coronavirusinfektionen i genomsnitt 12 %. Den utbredda prevalensen av coronavirus bevisas av specifika antikroppar som upptäckts hos 80 % av människorna [18] [19] .

Humant coronavirus isolerades först 1965 från ARVI- patienter av D. Tyrrel från nasofarynx med akut rinit , senare 1975 isolerade E. Kaul och S. Clark coronavirus från avföring vid enterokolit hos barn . Därefter väckte coronavirus nästan inte forskarnas uppmärksamhet, förrän ett utbrott av SARS, eller allvarligt akut respiratoriskt syndrom (SARS, SARS) , registrerades i Kina 2002-2003 . Sjukdomen orsakades av SARS-CoV-viruset. Som ett resultat spred sig sjukdomen till andra länder, totalt 8273 personer insjuknade, 775 dog (dödlighet 9,6%).

MERS-CoV-viruset är orsaken till Middle East Respiratory Syndrome (MERS), vars första fall rapporterades 2012 [20] . 2015 inträffade ett utbrott av luftvägssyndrom i Mellanöstern i Sydkorea , under vilket 183 personer insjuknade och 33 dog.

I december 2019 började ett utbrott av lunginflammation i Kina , orsakat av det nyupptäckta SARS-CoV-2- viruset . Det spred sig snart till andra länder.

Struktur och livscykel

Genomet representeras av enkelsträngat (+)RNA. Nukleokapsiden är omgiven av ett proteinmembran och ett lipo-innehållande yttre skal, från vilket klubbformade taggiga processer sträcker sig, som liknar en krona, som familjen fått sitt namn för.

SARS-CoV-2 använder S-proteinet på kronan för att fästa till dess receptor  , angiotensinomvandlande enzym 2 (ACE2), såväl som till serinproteaset TMPRSS2 [21] , liksom SARS-CoV (SARS)-viruset. [22] . Cellen omsluter viruset med sitt membran, och den resulterande membranvesikeln finns i cellens cytoplasma. De två cellreceptorproteinerna som nämns ovan transformerar det virala S-proteinet på ett sådant sätt att virus- och cellmembranet smälter samman [23] .

Efter att ha kommit in i cellen skapar viruset membranvesiklar med hjälp av intracellulära membran, till vilka speciella proteinkomplex är fästa. Dessa komplex syntetiserar en kopia av det virala genomiska RNA:t och korta mRNA:n för syntes av virala proteiner [24] .

Virusets RNA har en 5'-metylerad början och en 3'- polyadenylerad ände. Detta gör det möjligt för viruset att initiera sammansättning av sina proteiner på sitt RNA av cellens ribosomer , som inte kan avgöra om det är virusets RNA eller RNA för själva cellens proteiner.

Coronavirus har ett RNA på cirka 26-30 tusen baspar , vilket betyder att coronavirus har det största icke-segmenterade RNA:t av alla kända virus, det vill säga de är den mest komplexa i strukturen bland kända virus. Virusgenomet består av mer än 20 000 nukleotider och kodar för två replikativa polyproteiner pp1a och pp1ab [25] [26] , från vilka en kopia av virus-RNA:t bildas i nästa replikations-/translationspass, samt 8 separata mRNA- mallar för virala proteiner, som är oändligt de genereras. Genereringen av M-, S-, HE- och E-proteiner som kommer in i virusets membranlipidhölje sker på motsvarande mRNA i cellens endoplasmatiska retikulum ; N-proteinet, som kommer att omge det virala genomiska RNA:t, syntetiseras på mRNA som flyter i cellcytoplasman [24] .

Efter att ha mottagit virusets genomiska RNA och dess nödvändiga proteiner, närmar sig detta RNA, insvept i N-proteinet, proteinerna som sitter på det endoplasmatiska retikulumet och interagerar med dem. Som ett resultat täcker membranet i det endoplasmatiska retikulumet med de virala proteinerna detta RNA och bildar ett virion [24] . Virionerna frigörs sedan från den infekterade cellen via exocytos . Efter frisättningen av virioner från cellen dör den.

Taxonomi

Familjen coronavirus ( lat.  Coronaviridae ) inkluderar 2 underfamiljer och cirka 46 arter [27] :

Underfamiljen Letovirinae , isolerad 2018, inkluderar endast en accepterad art, undersläkte och släkte (dock har ytterligare två arter identifierats som ännu inte har godkänts officiellt):

Underfamiljen Orthocoronavirinae


Se även

Anteckningar

  1. ↑ Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) .
  2. ↑ 1 2 Atlas of Medical Microbiology, Virology and Immunology: Lärobok för medicinska studenter / ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M .  : Medicinsk informationsbyrå, 2003. - S. 121. - 236 sid. — ISBN 5-89481-136-8 .
  3. ↑ 1 2 Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. Studiehistoria och modern klassificering av coronavirus (Nidovirales: Coronaviridae)  // Infektion och immunitet . - 2020. - T. 10 , nr 2 . - S. 221-246 . - doi : 10.15789/2220-7619-H0I-1412 . Arkiverad från originalet den 25 juni 2020.
  4. ↑ Taxonomy of Viruses  på webbplatsen för International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Tillgänglig: 19 juli 2019)
  5. ↑ M. Yu. Shchelkanov, LV Kolobukhina, OA Burgasova, IS Kruzhkova, VV Maleev. COVID-19: etiologi, klinisk bild, behandling  // Russian Journal of Infection and Immunity. — 2020-05-06. - T. 10 , nej. 3 . — S. 421–445 . — ISSN 2220-7619 2313-7398, 2220-7619 . - doi : 10.15789/2220-7619-CEC-1473 . Arkiverad från originalet den 3 april 2022.
  6. ↑ Supotnitsky M. V. Det nya coronaviruset SARS-CoV-2 i aspekten av den globala epidemiologin av coronavirusinfektioner  // Bulletin of the RCB Protection Troops. - 2020. - Vol. 4 , nr. 1 . - S. 32-65 .
  7. ↑ Hemlig historia om de första coronavirusen Arkiverad 22 april 2020 på Wayback Machine // Forbes.
  8. ↑ Definition av Coronavirus av Merriam-Webster . Merriam Webster. Hämtad 24 mars 2020. Arkiverad från originalet 23 mars 2020.
  9. ↑ Definition av Corona av Merriam-Webster . Merriam Webster. Hämtad 24 mars 2020. Arkiverad från originalet 24 mars 2020.
  10. ↑ 1 2 Tyrrell, David Arthur John. Cold Wars: The Fight Against  the Common Cold ]  / David Arthur John Tyrrell, Michael Fielder. - Oxford University Press, 2002. - S. 96. - "Vi tittade närmare på utseendet på de nya virusen och märkte att de hade en sorts gloria runt dem. Tillgång till en ordbok gav den latinska motsvarigheten, corona, och så föddes namnet coronavirus." - ISBN 978-0-19-263285-2 . Arkiverad 18 november 2020 på Wayback Machine
  11. ↑ 1 2 Almeida JD, Berry DM, Cunningham CH, Hamre D, Hofstad MS, Mallucci L, McIntosh K, Tyrrell DA (november 1968). Virologi: Coronavirus. naturen . 220 (5168): 650. Bibcode : 1968Natur.220..650. . DOI : 10.1038/220650b0 . [T]här finns också en karakteristisk "kant" av projektioner 200 A långa, som är rundade eller kronbladsformade ... Detta utseende, som påminner om solkoronan, delas av mushepatitvirus och flera virus som nyligen återvunnits från människan, nämligen stam B814, 229E och flera andra.
  12. ↑ Sturman LS, Holmes KV (1983-01-01). Lauffer MA, Maramorosch K, red. "Coronavirusens molekylära biologi" . Framsteg inom virusforskning . 28 :35-112. DOI : 10.1016/s0065-3527(08)60721-6 . ISBN  9780120398287 . PMC  7131312 . PMID  6362367 . [D]essa virus visade en karakteristisk frans av stora, distinkta, kronbladsformade peplomerer eller spikar som liknade en krona, som corona spinarum i religiös konst; därav namnet coronavirus.
  13. ↑ Lalchhandama, Kholhring (2020). "Kronikorna om coronavirus: bronkit, hepatit och förkylning". Vetenskapsvision _ _ ]. 20 (1):43-53. DOI : 10.33493/scivis.20.01.04 .
  14. ↑ Carstens EB (2010). "Ratifikationsomröstning om taxonomiska förslag till International Committee on Taxonomy of Viruses (2009)" . Arkiv för virologi . 155 (1): 133-46. DOI : 10.1007/s00705-009-0547-x . PMC  7086975 . PMID  19960211 .
  15. ↑ Fan Y, Zhao K, Shi ZL, Zhou P (mars 2019). Fladdermus-coronavirus i Kina . Virus . 11 (3):210 . doi : 10.3390/ v11030210 . PMC 6466186 . PMID 30832341 .  
  16. ↑ Internationell kommitté för taxonomi av virus (ICTV  ) . talk.ictvonline.org . Hämtad 14 september 2020. Arkiverad från originalet 20 mars 2020.
  17. ↑ Gilmutdinov R. Ya., Galiullin A. K., Spiridonov G. N. Coronavirusinfektioner hos vilda fåglar  // Veterinärläkare. - 2020. - Utgåva. 6 . - S. 57-67 . - doi : 10.33632/1998-698X.2020-6-57-67 .
  18. ↑ Pulmonologi: en nationell riktlinje . - M.  : GEOTAR-Media, 2009.
  19. ↑ Shirobokov V.P. Medicinsk mikrobiologi, virologi och immunologi . - Vinnitsa: Ny bok, 2015. - S. 504-505.
  20. ↑ Korotyaev A.I. , Babichev S.A. Medicinsk mikrobiologi, immunologi och virologi . - St. Petersburg: SpecLit, 2008.
  21. ↑ Stasevich, 2020 , sid. 11-12.
  22. ↑ Xintian Xu, Ping Chen, Jingfang Wang, Jiannan Feng, Hui Zhou. Utvecklingen av det nya coronaviruset från det pågående Wuhan-utbrottet och modellering av dess spikeprotein för risk för mänsklig överföring  //  SCIENCE CHINA Life Sciences. - 2020. - Vol. 63 . — S. 457–460 . - doi : 10.1007/s11427-020-1637-5 . Arkiverad från originalet den 28 juni 2021.
  23. ↑ Stasevich, 2020 , sid. 10-12.
  24. ↑ 1 2 3 Stasevich, 2020 , sid. 12.
  25. ↑ Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology  (engelska) / V. Thiel (redaktör). — 1:a uppl. – Caister Academic Press, 2007. - ISBN 978-1-904455-16-5 .
  26. ↑ Familj - Coronaviridae // Virustaxonomi: nionde rapporten från den internationella kommittén för virustaxonomi  / Andrew MQ King, Michael J. Adams, Eric B. Carstens, Elliot J. Lefkowitz (red.). - Elsevier Inc., 2012. - P.  806 -828. — ISBN 978-0-12-384684-6 . - doi : 10.1016/B978-0-12-384684-6.00068-9 .
  27. ↑ Virus Metadata Repository: version 1 maj 2020; MSL35  // International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). - 2020. - 1 maj.

Litteratur

Länkar

  Gå till Wikidata-objektet  Ordböcker och uppslagsverk
Taxonomi
I bibliografiska kataloger