Molekylär symmetri är ett grundläggande begrepp i kemi som beskriver och klassificerar en molekyls symmetri , som används för att förutsäga eller förklara de kemiska egenskaperna hos molekyler, såsom dipolmoment och tillåtna spektroskopiska övergångar , till exempel . Studiet av molekylär symmetri är baserad på gruppteori , tillståndet för en molekyl klassificeras med hjälp av irreducerbara representationer från teckentabellen för molekylens symmetrigrupp.
Symmetri används i studien av molekylära orbitaler , med tillämpningar som Hückel-metoden , ligandfältteori och Woodward–Hoffmann-reglerna . En annan grund i stor skala är användningen av kristallsystem för att beskriva kristallografisk symmetri.
Det finns många metoder för att fastställa symmetrin hos en molekyl, inklusive röntgendiffraktionsanalys och olika former av spektroskopi . Spektroskopisk notation är baserad på symmetri.
Gruppteori används för att studera molekylär symmetri.
Rotationsaxel ( ) | Felaktiga rotationselement ( ) | ||
---|---|---|---|
Chiral nr |
Achiral reflektionsplan |
Achiralt symmetricentrum | |
Punktsymmetrigruppen för en molekyl kan beskrivas av fem typer av symmetrielement .
De fem symmetrielementen har fem typer av symmetrioperationer förknippade med dem , som gör att molekylen inte går att skilja från det initiala tillståndet. De är ibland markerade med en " vagn " eller " cirkumflex " (lock) för att särskilja symmetrielementen. Sedan är rotationen av molekylen runt axeln, och är identitetsoperationen. Ett symmetrielement kan ha mer än en symmetrioperation associerad med sig. Till exempel är axeln för en kvadratisk xenonfluoridmolekyl ( ) associerad med två rotationer på 90° i motsatta riktningar och en rotation på 180°. Eftersom är ekvivalent med , är ekvivalent med och är ekvivalent med î , kan alla symmetrioperationer delas in i korrekta och felaktiga rotationer.
För linjära molekyler är rotation medurs eller moturs längs molekylens axel genom valfri vinkel en symmetrioperation.
Symmetrioperationerna för en molekyl (eller annat objekt) bildar en grupp . I matematik är en grupp en mängd med en binär operation som uppfyller de fyra egenskaperna nedan.
I en symmetrigrupp är elementen i gruppen symmetrioperationerna (inte symmetrielementen) och binära kombinationer består av att tillämpa en operation och sedan en annan. Ett exempel är sekvensen av rotation kring z - axeln och reflektion kring xy- planet , som betecknas med . Enligt konvention utförs operationer från höger till vänster.
Symmetrigruppen har alla egenskaper hos grupper.
Ordningen för en grupp är antalet element i gruppen. För grupper av liten ordning kan gruppens egenskaper enkelt kontrolleras genom att överväga tabellen med kompositioner, där raderna och kolumnerna motsvarar elementen i gruppen och cellerna i tabellen motsvarar deras produkt.
Den successiva appliceringen (eller sammansättningen ) av en eller flera symmetrioperationer av en molekyl har en effekt som är likvärdig med tillämpningen av en enda symmetrioperation. Till exempel ses rotation följt av reflektion som en symmetrioperation . (Operation A följt av operation B för att bilda operation C skrivs som BA = C ) [3] . Dessutom tillfredsställer uppsättningen av alla symmetrioperationer (inklusive sammansatta operationer) alla egenskaper hos gruppen som anges ovan. Så ( S , * ) är en grupp, där S är mängden av alla symmetrioperationer av samma molekyl, och betyder sammansättningen (återtillämpning) av symmetrioperationer.
Denna grupp kallas molekylens punktgrupp eftersom många symmetrioperationer lämnar åtminstone en punkt fixerad (även om axeln eller planet för vissa symmetrier förblir fixerad). En punktgrupp är med andra ord en grupp som summerar alla symmetrioperationer som molekyler i en given kategori har [3] . Symmetrin hos en kristall, däremot, beskrivs av en kristallografisk grupp av symmetrioperationer, som inkluderar parallella översättningar i rymden.
Det är möjligt att bestämma punktgruppssymmetrioperationer för en viss molekyl genom att beakta den geometriska symmetrin för molekylens molekylmodell. Men om en punktgrupp används för att klassificera en molekyls tillstånd tolkas inte operationerna i den på samma sätt. Istället tolkas operationerna som rotationer och/eller reflektioner av de elektroniska vibrationskoordinaterna [4] och dessa operationer pendlar med den vibrationella Hamiltonian. De är "symmetrioperationerna" för denna Hamiltonian. Punktgruppen används för att klassificera vibrationsegentillstånd efter symmetri. Klassificering av symmetri av rotationsnivåer, egentillstånd för den kompletta (rotations-vibrations-elektroniska) Hamiltonian kräver användning av en lämplig permutations-inversionsgrupp, som i Longuet-Higgins [5] .
Att tilldela en punktgrupp till varje molekyl klassificerar kategorier med liknande symmetriegenskaper. Till exempel och har identiska symmetrioperationer [6] . De kan alla genomgå samma E- operation , två rotationer och tre olika planreflektioner utan att förlora sin identitet, så de har alla samma punktgrupp av ordning 6 [3] . På samma sätt delar vatten ( ) och vätesulfid ( ) identiska symmetrioperationer. Båda ämnena kan genomgå identisk operation E , en rotation och två reflektioner utan att förlora sin identitet, så att båda ämnena har samma punktgrupp av ordning 4 [7] . Detta klassificeringssystem hjälper forskare att studera molekyler mer effektivt eftersom kemiska molekyler med samma punktgrupp har liknande bindningsmönster, bindningsdiagram och spektrala egenskaper [3] .
Följande tabell innehåller många av de punktgrupper som är tillämpliga på molekyler. Grupper är märkta med Schoenflies-symboler , som vanligtvis används inom kemi och molekylär spektroskopi. Beskrivningarna inkluderar molekylernas allmänna former, vilket kan förklaras med AETR-modellen . I varje rad har beskrivningar och exempel inte högre symmetri, vilket innebär att den angivna punktgruppen fångar alla punktsymmetrier.
prickgrupp | Symmetrioperationer [8] | En enkel beskrivning av typisk geometri | Exempel 1 | Exempel 2 | Exempel 3 |
C1 _ | E | Ingen symmetri, kiral | Bromklordifluormetan (båda enantiomererna visas ) |
Lyserginsyra |
L-leucin och de flesta andra aminosyror utom glycin |
Cs _ | Reflektionsplan | Tionylklorid |
Hypoklorsyra |
Chloriodomane | |
Ei _ | Symmetricentrum | mesovinsyra |
Slemsyra (mesogmjölksyra) |
( S , R ) 1,2-dibrom-1,2-dikloretan ( anti -konformator ) | |
Linjär | Vätefluorid (och alla andra heteronukleära diatomiska molekyler ) |
Kväveoxid (dikväveoxid) |
Blåvätesyra (cyanväte) | ||
Linjär med inversionscentrum | Syre (och alla andra homonukleära diatomiska molekyler ) |
Koldioxid |
Acetylen (etyn) | ||
"Geometri av en öppen bok", chiral | Väteperoxid |
Hydrazin |
Tetrahydrofuran (twist konformation, vriden konformation) | ||
propeller, kiral | Trifenylfosfin |
Trietylamin |
Ortofosforsyra | ||
Platt med symmetricentrum, inget vertikalt plan | Trans - 1,2-dikloretylen |
Trans - difluordiazin |
Trans - azobensen | ||
Propeller | Borsyra |
Floroglucinol (1,3,5-trihydroxibensen) |
|||
Vinkel ( ), sväng ( ) eller T -formad (ClF 3 ) | Vätemonoxid |
Svaveltetrafluorid |
klorfluorid | ||
Trigonal-pyramidal | Icke-inverterad ammoniak |
Fosforoxiklorid |
Tetrakarbonylkoboltsyra , HCo(CO) 4 | ||
fyrkantig pyramidform | xenonoxidtetrafluorid |
Pentaborane , B5H9 _ _ |
Nitroprussidanjon [Fe(CN) 5 (NO)] 2− | ||
Mjölkande avföringskomplex | Cyklopentadienylnickelnitrosyl |
Korannulen |
|||
Vriden, kiral | Bifenyl (skev konformation) |
Twistan ( C10H16 ) _ _ |
cyklohexankonformation (twist) | ||
Trippel helix, kiral | Tris(etylendiamin)kobolt(III)katjon | Järn(III)tris-oxalatanjon | | |||
Platt med symmetricentrum, vertikalt plan | Eten |
Pyrazin |
Diboran | ||
Triangulär platt eller triangulär bipyramidform | Bortrifluorid |
Fosfor (V) klorid |
Cyklopropan | ||
platt kvadrat | Xenon(IV)fluorid |
Kaliumoktaklordimolybdatanjon |
Trans - [Co III (NH 3 ) 4 Cl 2 ] + (exklusive väteatomer) | ||
Femsidig | Cyklopentadienylanjon |
Rutenocen |
Fulleren C70 | ||
Hexagonal | Bensen |
Bis(bensen)krom |
Coronen ( C 24 H 12 ) | ||
halvkantiga | Tropilia ion () katjon |
||||
Åttkantig | Anjon av cyklooktatetraen ( ) |
Ouranocene |
|||
90° sväng | Allen |
Tetrasvaveltetranitrid |
Diborane (exciterat tillstånd) | ||
60° rotation | Etan (sicksack rotationsisomer ) |
Oktakarbonyldikobalt ( icke-bryggad isomer ) |
Cyklohexankonformation (fåtölj) | ||
45° sväng | Sulphur (kronans konformation) |
Dimangan dekakarbonyl (sicksack roterande isomer) |
Octafluoroxenate(VI)-anjon (idealiserad geometri) | ||
36° sväng | Ferrocen (roterande isomer i sicksack) |
||||
1,2,3,4 - tetrafluorspiropentan [9] > |
|||||
tetraedrisk | Metan |
Fosfor(V)oxid |
Adamantane | ||
Ikosaeder med pyrit-hedrisk symmetri | Vissa C60 fulleren hexaaddukter [10] | ||||
Oktaedrisk eller kubisk | Svavel(VI)fluorid |
Molybdenhexakarbonyl |
kubansk | ||
Ikosaedral eller dodekaedral | Buckminsterfullerene |
Anjon av dodecaborate |
Dodekaeder |
Symmetrioperationer kan representeras på många sätt . Vanligtvis representeras av matriser . För varje vektor som representerar en punkt i ett kartesiskt koordinatsystem, ger vänster multiplikation med en matris punktens nya position efter symmetrioperationen. Sammansättningen av operationer motsvarar matrismultiplikation. I en punktgrupp leder multiplicering av matriser med två symmetrier till en matris av en annan symmetrioperation i samma punktgrupp [3] . Ett exempel är
Även om det finns ett oändligt antal sådana representationer, används ofta irreducerbara grupprepresentationer , eftersom alla andra representationer kan beskrivas som en linjär kombination av irreducerbara representationer.
För varje punktgrupp sammanfattar teckentabellen information om symmetrioperationer och om dess irreducerbara representationer. Eftersom antalet irreducerbara representationer alltid är lika med antalet klasser av symmetrioperationer, är tabellerna kvadratiska.
Tabellen i sig är uppbyggd av tecken som representerar hur en viss irreducerbar representation förändras om en viss symmetrioperation tillämpas. Varje symmetrioperation i en molekyls punktgrupp, som verkar på molekylen, lämnar molekylen oförändrad. Men när man agerar på ett generiskt objekt som en vektor eller en orbital är detta inte nödvändigtvis fallet. En vektor kan ändra riktning och en orbital kan ändra typ. För enkla punktgrupper är värdena antingen 1 eller −1. 1 betyder att tecknet eller fasen (för en vektor eller orbital) inte ändras av symmetrioperationen ( symmetrisk operation ), medan −1 betyder att tecknet är omvänt ( asymmetrisk operation ).
Vyer är märkta enligt en uppsättning konventioner:
Tabellerna innehåller också information om hur de kartesiska koordinatrotationsvektorerna runt dem och kvadratiska funktioner förändras under verkan av gruppsymmetrioperationer genom att specificera vilken irreducibel representation som fungerar på samma sätt. Dessa förtydliganden ges i tabellens högra kolumner. Denna ytterligare information är användbar eftersom de kemiskt viktiga orbitalerna (särskilt p- och d -orbitalerna ) har samma symmetri som dessa strukturer.
Teckentabellen för punktsymmetrigruppen ges nedan:
ett | ett | ett | ett | z | ||
ett | ett | −1 | −1 | xy | ||
ett | −1 | ett | −1 | xz | ||
ett | −1 | −1 | ett | yz |
Betrakta exemplet med vatten ( ), som har den symmetri som beskrivs ovan . Syrebanan har symmetri som i fjärde raden i teckentabellen ovan, med x i den sjätte kolumnen). Den är placerad vinkelrätt mot molekylens plan och byter tecken under operationerna och , men förblir oförändrad under de andra två operationerna (naturligtvis är tecknet för den identiska operationen alltid +1). Då är uppsättningen av orbitala tecken {1, −1, 1, −1}, vilket motsvarar en irreducerbar representation av . På liknande sätt har 2 p z orbitalen symmetrin för den irreducibla representationen (det vill säga ingen av symmetrioperationerna ändrar den), orbitalen har symmetri och orbitalen har symmetri .
Hans Bethe använde karaktärerna för punktgruppsoperationer när han studerade ligandfältteori 1929, och Eugene Wigner använde gruppteori för att förklara valet av regler för atomspektroskopi [11] . Den första teckentabellen skapades av Laszlo Tissa (1933) i samband med vibrationsspektra. Robert Mulliken var den första som publicerade teckentabeller på engelska (1933), och E. Bright Wilson använde dem 1934 för att förutsäga symmetri av normala vibrationer [12] . En komplett uppsättning av 32 kristallografiska punktgrupper publicerades 1936 av Rosenthal och Murphy [13] .
Som diskuterats ovan i punktgrupper och permutations-inversionsgrupper är punktgrupper användbara för att klassificera vibrationstillstånden hos stela molekyler (ibland kallade halvstyva molekyler) som endast genomgår små vibrationer runt en jämviktsgeometri. Longuet-Higgins introducerade en mer allmän typ av symmetrigrupp, lämplig inte bara för klassificering av rovibroniska tillstånd av stela molekyler, utan också för klassificering av tillstånd av icke- styva (eller fluktuerande ) molekyler som övergår till ekvivalenta geometrier (kallade versioner [14 ) ] ), vilket kan orsaka effekten av distorsion av molekylens rotation [5] . Dessa grupper är kända som permutations-inversionsgrupper eftersom deras symmetrioperationer är energetiskt möjliga permutationer av identiska kärnor, inversion med avseende på masscentrum ( paritetsoperation ), eller en kombination av dessa operationer.
Till exempel har etan ( ) tre ekvivalenta hindrade konformationer [2] . Övergången mellan konformationer sker vid vanliga temperaturer genom intern rotation av metylgruppen i förhållande till de andra beståndsdelarna. Detta är inte en rotation av hela molekylen runt axeln . Även om varje konformation har symmetri , som i tabellen ovan, kräver beskrivningen av interna rotationer och associerade kvanttillstånd och energinivåer en mer komplett permutations-inversionsgrupp .
På samma sätt har ammoniak ( ) två pyramidformade ( ) konformationer som omvandlas till varandra i en process som kallas pyramidal inversion . Detta är inte en punktgruppsinversionsoperation i i stela molekyler med central symmetri eftersom den inte har något symmetricentrum. Snarare är det en förändring av kärnan och elektroniska koordinater i molekylens masscentrum (kallas ibland paritetsoperationen), som visar sig vara energetiskt möjlig för denna molekyl. En lämplig permutations-inversionsgrupp att använda i denna situation är , som är isomorf till punktgruppen .
Dessutom har som exempel metan ( ) och molekyler symmetriska jämviktsstrukturer med symmetripunktgrupper resp . De saknar permanenta elektriska dipolmoment, men de har mycket svaga rotationsspektra på grund av rotationscentrifugal distorsion [15] [16] . De permutations-inversionsgrupper som krävs för en fullständig studie av molekylerna och är resp .
Den andra och mindre generella strategin för symmetri av icke-styva molekyler tillhör Altman [17] [18] . I detta tillvägagångssätt är symmetrigrupper kända som Schrödinger-supergrupper och består av två typer av operationer (och deras kombinationer): (1) geometriska symmetrioperationer (rotation, reflektion i planet, central symmetri) av stela molekyler och (2) isodynamiska operationer som översätter icke-rigida molekyler till energetiskt ekvivalenta former genom fysikaliska processer som rotation av en enkelbindning (som i etan) eller permutationer i en molekyl (som i ammoniak) [18] .