DDR1

DDR1
Tillgängliga strukturer
PDB Ortologisk sökning: PDBe , RCSB
Identifierare
SymbolDDR1  ; CAK; CD167; DDR; EDDR1; HGK2; MCK10; NEP; NTRK4; PTK3; PTK3A; RTK6; TRKE
Externa ID:nOMIM:  600408 MGI :  99216 HomoloGene :  68212 ChEMBL : 5319 GeneCards : DDR1 Gene
EG-nummer2.7.10.1
RNA-uttrycksprofil
Mer information
ortologer
SeMänskligMus
Entrez78012305
EnsembleENSG00000137332ENSMUSG00000003534
UniProtQ08345Q03146
RefSeq (mRNA)NM_001202521NM_001198831
RefSeq (protein)NP_001189450NP_001185760
Locus (UCSC)Chr 6:
30,84 – 30,87 Mb
Chr 17:
35,68 – 35,7 Mb
Sök i PubMed[ett][2]

DDR1 ( diskoidindomänreceptortyrosinkinas  1 ; CD167a , EC 2.7.10.1 ) är ett membranprotein , ett enzym från superfamiljen av receptortyrosinkinaser , en produkt av DDR1 - genen .

DDR1 är en del av en grupp receptorer som innehåller en domän som är homolog med discoidin 1-proteinet från Dictyostelium discoideum .

Funktioner

DDR1-receptorn spelar en roll i intercellulära interaktioner och igenkänning. [1] Interaktionen mellan leukocyt DDR1 och kollagen underlättar vidhäftning, migration, differentiering/mognad av leukocyter och deras produktion av cytokiner och kemokiner . [2]

Struktur

DDR1 är ett stort protein, består av 895 aminosyror , molekylvikten för proteindelen är 101,1 kDa . Den N-terminala regionen (398 aminosyror) är extracellulär, följt av ett enda transmembranfragment och ett intracellulärt fragment (470 aminosyror). Det extracellulära fragmentet inkluderar 4 N-glykosyleringsställen . Det cytosoliska stället inkluderar en proteinkinasdomän, ett ATP -bindningsställe , 4 autofosforylerade tyrosiner och ett PPxY- motiv.

Receptorn interagerar med WWC1 (via WW-domäner), går in i ett trimolekylärt komplex med WWC1- och PRKCZ-proteiner (vanligtvis i ett kollagenfritt tillstånd).

Som ett resultat av alternativ splitsning bildas 5 proteinisoformer.

Katalytisk aktivitet

Den intracellulära proteinkinasdomänen fosforylerar sina egna tyrosinrester och överför en fosfatgrupp från ATP till en aminosyrahydroxylgrupp. Autofosforylering uppstår när DDR1 interagerar med typ I-VI kollagener.

Vävnadsspecificitet

Proteinet uttrycks i liten utsträckning på epitelcellerna i de flesta vävnader, det maximala uttrycket observeras i hjärnan , lungorna, moderkakan och njurarna. En hög grad av uttryck finns i många karcinomcellinjer, särskilt i bröstcancerceller. Frånvarande i bindväv, på endotelceller, i fett- och muskelvävnader och på hematopoetiska celler.

Se även

Anteckningar

  1. Uniprot-databaspost för CD11a (accessionsnummer Q08345) . Hämtad 17 april 2012. Arkiverad från originalet 28 augusti 2017.
  2. Yoshimura T., Matsuyama W., Kamohara H. Discoidin-domänreceptor 1: en ny klass av reglerande receptorleukocyt-kollageninteraktion   // Immunol . Res. : journal. - 2005. - Vol. 31 , nr. 3 . - S. 219-230 . - doi : 10.1385/IR:31:3:219 . — PMID 15888913 .

Bibliografi

Länkar